В настоящее время университет осуществляет подготовку специалистов в рамках многоуровневой структуры высшего образования в соответствии с государственной лицензией АА № 0000213 от 5 июня 2004 года на право ведения образовательной деятельности в сферах среднего профессионального, высшего и послевузовского профессионального образования без ограничения срока действия:
- по 47 специальностям высшего профессионального образования (Классификатор 2006 года). При этом срок обучения в бакалавриате - 4 года, на заочной форме обучения - 5 лет, получение высшего образования по сокращенной форме: на базе высшего образования – 2 года,  на базе среднего профессионального образования – 3 года.
- по 19 специальностям магистратуры.
В университете внедряется кредитная система обучения: с 2003-04 учебного года - для студентов экономических специальностей; с 2004-05 учебного года - для студентов 1 курса всех специальностей высшего профессионального образования (кроме специальности «Медико-биологическое дело»).
В настоящее время учебный процесс осуществляется на 8 факультетах 33 кафедрами, в том числе: 27 – специальными, 6 – общеобразовательными.